По имеющимся данным, такие кислоты, как лимонная и щавелевая, могут накапливаться грибами в большом количестве (до 10%). Эти кислоты являются сильными катионкомплексирующими агентами и могут образовывать с минералами породы растворимые комплексные соединения. Ряд авторов изучали эту хелатирующую способность грибов, выделенных с поврежденных камней. Самый высокий уровень комплексообразования обнаружен у изоляторов рода Penicillium и Cephalosporium. Установлена корреляция между количеством лимонной кислоты, которое образует Penicillium simplissimum и количеством Mg, Fe, Аl и Si, переведенных в растворимое состояние из базальта. Аналогичным образом дереворазрушающие грибы в зоне непосредственного контакта с бетоном создают условия для образования растворимых в воде солей (муравьинокислый кальций, ацетат кальция и др.), что в конечном итоге снижает механическую прочность бетона.
Говоря о возможных механизмах деградации камня при действии грибов, следует напомнить также, что в условиях резкого углеродного голодания и при наличии в субстрате доступных источников азота грибы способны вести себя как бактерии нитрификаторы — добывать энергию путем окисления аминного и амиачного азота до нитратов, продуцируя азотную кислоту.